兵部并入五军都督府的旨意毫无疑问地引起了轩然大波。
首先出手引发风波的就是六科给事中。
此次事件在六科看来，完全就是皇帝在打压文臣，尤其是在他们与都察院联手弹劾过石亨杨洪等人之后，皇帝所采取的报复行动。
六科郎基本上都是年轻人，又手握封驳大权，监督朝廷政令，正是文人眼中意气风发、大展身手之时，这次皇帝又是发的明旨，而且还不符合规制流程，正撞到六科手中。
于是，六科郎们齐心协力，直接要以有违祖制之名封驳了皇帝的圣旨。
只是这时吏部尚书王直找到了他们，经过一番商谈，也不知道王直是如何说服六科郎的，总之，结果就是六科郎们偃旗息鼓，不再发难。圣旨顺利下发，兵部并入五军都督府，哦不，是兵部并入大都督府的事情正式进入实施阶段，兵部开始统计人员，计算物资，设计业务，大都督府的都督们则是翘首以盼，等待兵部并入的那一天，摩拳擦掌地等着到时候给兵部这些文官一些颜色看看。
第二波出手的是都察院的监察御史们。
他们的行动很简单，那就是坚决抵制圣旨的执行，绝不响应皇帝的号召，申请加入大都督府。
监察御史是言官，是清流，和大都督府那群兵痞杀才不是一路人，如果去兵部还能接受，去大都督府是绝对不能接受的。
对此，朱祁钰是无所谓，反正大都督府本就有断事官掌军法，数量虽然少，但不是没有，明年就要开科举了，大不了让于谦多提拔一些人便是，天底下三条腿的蛤蟆不好找，两条腿的文人还是不缺的。
至于不配合的监察御史们，朱祁钰早就想到了方法整治他们，此事先记下来，回头再说。
摆平或者无视这两拨人，旨意便再没有阻拦的人，之后的事情由于谦和大都督府的都督们去操心。
散朝之后，朱祁钰留下了大都督府的文武官员，打算详细说一下自己的想法，明确分割一下双方的职权，免得兵部并入进去之后再闹什么幺蛾子。
入殿分坐之后，朱祁钰笑着对在座泾渭分明的文武官员道：“诸位爱卿，今日招你们前来，是想商议一下大都督府的权责分配，这是朕昨日思考的权责分配方案，诸位先看一下，讨论一下有什么不适合的地方，说给朕听听。”
说完让今天轮值伺候的太监王成将一大摞纸张分下去，交到在座的文武官员手里。
于谦扫了一遍就将纸张放在一旁，他昨天已经开过会了，权限什么的都比较清楚，不需要再问。
而都督们则是仔仔细细地看了一遍。
武清侯石亨问道：“陛下，您说要建军法司，臣请问，军法司由何人掌管，又以何人充之？”
朱祁钰的纸张上只写了衙门和职责，并没有写人名，于是答道：“军法司昨日朕已决定交于兵部于尚书掌管了，整个军法司按照都察院十三道御史来设置，每一道按照情况安排军法官，从此以后，军伍之人有没有罪，由军法官按照我大明军律来断定，其他人等不得过问。”
这个军法司是于谦没听过的，不过也无所谓，反正都是断狱判罪之事，做什么都一样做。
前军都督府右都督张軏出声道：“恕臣斗胆，陛下是说，今后我等军伍之人行事，都察院十三道御史不再监察了吗？”
他是靖难大将、河间王张玉的弟弟，前阵子刚刚从云贵回来，没想到刚回来就碰上了这等大事。
朱祁钰点点头，道：“对，从此以后，军中之事由军中之人处理，其他衙门不得插手，都察院自然也包含在内。”
“臣知道了。”张軏很满意，这意味着今后朝廷其他衙门都没办法将手插进大都督府，自己做起什么事情也方便许多。
朱祁钰看到他满意的神情，又补充了一句：“而且军法司虽然隶属于大都督府，但是直属于兵部尚书，任何人不得干涉，包括你们这些原来五军都督府的都督们。”
“这怎么能行？军法司隶属于大都督府，为何不许我等干涉？若是他们犯了错，或者故意找茬呢？”张軏连忙道，文官们再也不能对军方指手画脚，他们很满意，但是内部的军法司他们都管不了，那怎么能行？
“怎么不行？”朱祁钰反问道：“朕知道你的意思，无非就是今后不能随意使用军法而已，但是你看看石亨他们干的好事，你们为宫聚等人上书是因为什么，真的当朕一无所知吗？宫聚都是什么品级了，他差那点银子么？居然还贪图那点缴获的银钱，那些银子是什么银子，那是国库的银子，大明的银子，朕的银子，从朕手中抢钱，朕没诛其三族已经不错了，你们还敢算计朕，真当朕是傻子吗？”
朱祁钰越说越气，最后几乎是怒吼出声，吓得张軏和石亨连忙跪倒，连声道：“臣知错了，请陛下恕罪。”
看着跪在地上的二人，朱祁钰又道：“而且朕这次整合军务，为的是什么？还不是为了让你们和文臣少点冲突，多拿出点精力去做本职工作，朕的确是需要你们来守卫大明江山，但没说天下只有你们能守卫，所以，别总是惦记着自己那点家资，真做到了平定天下，朕赏你们实封都没问题。”
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